Еще летом Минтранс уволил Сергея Мусеева с должности: основанием стали результаты проверки контрольно-ревизионного управления.
Владимир Бадагов, зам. министра транспорта и связи (28 марта 2008): «Первое, что инкриминировалось господину Мусееву, что стало поводом для его увольнения - это грубые нарушения финансово-хозяйственной дисциплины. Это первое, на основе проверки КРУ предприятия это все обозначилось. Дела переданы в прокуратуру, и мы обязаны его уволить. Это первое. Второе. Скорость этого решения усугубило то, что несколько дней назад была самодельная авария на станции «Барабашова» и другая попытка сегодня остановить эту же линию метрополитена. Это все мы считаем как диверсии».
Исполняющим обязанности начальника подземки Иосиф Винский тогда назначил Геннадия Броншпака. Сергей Мусеев назвал увольнение незаконным и опротестовал в суде. Тем временем Минтранс объявил конкурс - на должность начальника Харьковского метрополитена. Победил в нем Геннадий Броншпак.
Тринадцатого ноября ему резко стало плохо: из-за состояния здоровья Броншпак написал заявление об увольнении по собственному желанию, рассказал «МедиаПорту» бывший пресс-секретарь подземки Олег Перегон, который уволился вслед за начальником.
Сам Сергей Мусеев считает свое возвращение в кресло, по решению суда, не только законным, но и закономерным. Несмотря на то, что непосредственное руководство - министерство транспорта - об это даже не знало.